菜园新石器时代文化遗址位于海原县西安镇菜园自然村西、南、东的山梁坡地上，面积41250平方米，村落位于南华山脚下，南倚灵光寺、东靠海城镇野狐坡村。
1984年宁夏进行全区性的文物普查时发现了菜园新石器时代文化遗址。1985年5月宁夏考古研究所对部分遗址进行了试掘。秋季对遗址、墓葬进行科学、系统的发掘。1986年至1988年底，中国历史博物馆．北大考古系、宁夏考古研究所联合进行考古发掘。连续四年的清理发掘工作，共布探方297个，总揭露面积6921平方米，清理墓葬138座、房址15座、窖穴灰坑65个、窑址1座、灰沟1条，出土各类完整或可辨器物5000余件，主要为石、陶、骨、玉等生产工具，生活器皿和其它装饰品。其文化内涵揭示出：齐家文化的主体是从“菜园遗存”中孕育出来的，是自成体系的原始土著文化，并且具备了三个要素，即：时间界域、空间范围、独具特色的实物群体。菜园遗址距今已5000年，是古人类生息、繁衍、生产劳动的场所和墓葬地，处于母系氏族向父系氏族过渡时期。在宁夏南部山区，甘肃陇东纵横数百里的范围内，尽管有六盘山的阻隔，但清水河、葫芦河、泾水河等各个流域的先民们仍是交流频繁，共同创造了具有浓厚地域特征的原始文化，菜园遗址则是这一文化的典型代表。
菜园新时期文化遗址现为全国重点文物保护单位。
